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AI コーディングツールに API キーや秘密情報を読ませないための設定:Claude Code・Codex・Gemini CLI 共通の対策

.env や認証情報ファイルを Claude Code、Codex、Gemini CLI に読ませないための具体的な設定(permissions の deny、サンドボックス、除外設定)と、読ませてしまった場合の対処、そもそも秘密情報をリポジトリに置かない構成を解説します。